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贾盼盼,刘胜辉,余虹霖,张秀梅,孙伟生,林文秋,吴青松.利用SNP标记鉴定‘MD2’ב巴厘’/‘红皮’杂种真实性[J].中国南方果树,2025,54(6):
利用SNP标记鉴定‘MD2’ב巴厘’/‘红皮’杂种真实性
Identification of 'MD2' × 'Ba li'/' Hong pi ' Hybrid Authenticity by SNP Markers
投稿时间:2024-07-30  修订日期:2024-08-29
DOI:10.13938/j.issn.1007-1431.20240405
中文关键词:  菠萝  SNP标记  杂种真实性  鉴定
英文关键词:Pineapple  SNP marker  Hybrid authenticity  Identification
基金项目:本研究由农业农村部农垦局物种资源保护项目 (No.21240080)、国家热带植物种质资源库 (No.1 NTPGRC2023-027)、农业农村部物种品种资源保护费项目 (No.102125171630060009001)和中国热带农业科学院基本科研业务费专项(No.1630062024010)共同资助。
作者单位E-mail
贾盼盼 华中农业大学园艺林学学院 jiapanpan2022@163.com 
刘胜辉 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业农村部热带果树生物学重点实验室,海南省菠萝种质创新与利用工程技术研究中心,湛江 Lizx2002@126.com 
余虹霖 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业农村部热带果树生物学重点实验室,海南省菠萝种质创新与利用工程技术研究中心,湛江 18487656021@163.com 
张秀梅 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业农村部热带果树生物学重点实验室,海南省菠萝种质创新与利用工程技术研究中心,湛江 asiazhang1975@163.com 
孙伟生 中国热带农业科学院三亚研究院,三亚 sunweisheng1234@sina.com 
林文秋 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业农村部热带果树生物学重点实验室,海南省菠萝种质创新与利用工程技术研究中心,湛江 linwenqiu1989@163.com 
吴青松* 中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,农业农村部热带果树生物学重点实验室,海南省菠萝种质创新与利用工程技术研究中心,湛江 hnwuqs@163.com 
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中文摘要:
      杂交是菠萝新品种选育的重要手段,快速鉴定F1杂交子代的真实性在新品种选育和遗传学研究中具有重要作用。本研究利用SNP标记对‘MD2’ב巴厘’和‘MD2’ב红皮’两个菠萝混合群体进行真实性鉴定,并通过测序验证基因分型。结果表明,SNP12371、SNP6368、 SNP30159可区分‘MD2’、‘巴厘’及其F1子代;SNP14898可区分‘MD2’、‘红皮’及其F1子代。利用4组引物对289株杂交混合群体进行杂种真实性鉴定,结果显示‘MD2’和‘巴厘’的杂种后代为102株,‘MD2’和‘红皮’的杂种后代为162株,混合群体的真杂种率为91.35 %。杂交子代PCR测序结果与SNP分型结果一致。表明,开发的SNP12 371、SNP6368、 SNP30159和 SNP14 898可用于鉴定‘MD2’、‘巴厘’和‘红皮’的杂交子代真实性。本研究建立SNP标记鉴定菠萝F1子代杂种真实性的方法,为菠萝新品种选育及遗传基础研究奠定基础。
英文摘要:
      Hybridization is an important method for developing new pineapple varieties. Rapid identification of the authenticity of F1 hybrid offspring plays a crucial role in the breeding of new varieties and genetic research. In this study, SNP markers were used to authenticate two pineapple hybrid populations, "MD2" × "Bali" and "MD2" × "Hong Pi", and gene genotyping was validated by sequencing. The results showed that SNP12371, SNP6368, and SNP30159 could distinguish "MD2", "Bali", and their F1 offspring, while SNP14898 could distinguish "MD2", "Hong Pi", and their F1 offspring. Using four sets of primers, the authenticity of hybrids in a mixed population of 289 plants was identified, resulting in 102 hybrid offspring offspring from "MD2" and "Bali" and 162 hybrid offspring from "MD2" and "Hong Pi", with a true hybrid rate of 91.35%. The sequencing results of the hybrid offspring PCR were consistent with the SNP genotyping results. This indicates that the developed SNP12371, SNP6368, SNP30159, and SNP14898 markers can be used to authenticate the hybrid offspring of "MD2", "Bali", and "Hong Pi". This study establishes a method for identifying the authenticity of pineapple F1 hybrid offspring using SNP markers, laying a foundation for the breeding of new pineapple varieties and genetic research.
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